珍藏版 史上最全的基因编辑常用技术指南(5)
2023-03-16 来源:你乐谷
◉ Cre-Switch系统(Cre-off/on):对于Cre-Switch,则是在LoxP序列之间插入了两个阅读框,而这两个阅读框的方向相反,可以通过Cre酶的存在与否来控制这两个基因的表达。
Cre-loxp系统的优点:
说到这里,大家是不是都觉得Cre-loxp系统是一个非常有趣的工具?Cre-LoxP系统是在神经系统中应用最广泛的条件性基因敲除工具,Cre-loxp系统优点如下:
◉ 高效性:Cre重组酶与具有LoxP位点的DNA片段形成复合物之后,可以提供足够的能力引发之后的DNA重组过程,重组过程简约高效;
◉ 特异性强:LoxP序列的唯一性,保证基因重组的特异性;
◉ 应用范围广:Cre重组酶可以在生物体不同的组织、不同的生理条件下发挥作用;
◉ 可由二型启动子启动表达:Cre重组酶的编码基因可由任何一种二型启动子驱动,由此保证Cre重组酶在生物体不同的细胞、组织、器官或者在不同的发育阶段或不同的生理条件下表达,从而实现较高的组织和细胞特异性。
Cre/loxp系统的应用:
Cre/loxp系统是一种完善的研究工具,由于上述优点而应用广泛,尤其是在转基因小鼠领域。最常见的用途有:
◉ Cre依赖性基因表达:在目标基因上游放置两边都带有loxP位点的终止密码子(通常称为“ lox-stop-lox”或“ LSL”表达盒),在没有Cre重组酶的情况下,将阻止基因表达;在Cre存在的情况下,切除终止密码子,基因表达;
◉ Cre依赖性基因敲除:将loxP位点置于基因的两侧(称为“ floxing”,意为“flanked by loxP”),在Cre不存在时允许基因表达;当Cre存在时该基因表达将被破坏或删除;
◉ 选择标记的去除:在常规的小鼠编辑中,通常使用选择标记进行目标克隆筛选,但是在初始选择过之后,通常希望删除标记。此时通过对选择标记进行floxing处理,利用Cre可轻松执行此操作;
◉ 调节Cre表达:在发育的某些阶段通过将Cre置于特异性启动子下游,或通过将Cre置于诱导启动子(例如强力霉素诱导表达系统),这样Cre重组酶只能在指定的细胞中或指定的时间表达,同时结合上述一些loxP使用方法,可以进行不同要求的基因修饰。
四、CRISPR
CRISPR是细菌免疫系统的重要组成部分,可使细菌记住并破坏噬菌体。在基因编辑应用中,Cas9核酸内切酶通过gRNA序列进行靶向,从而诱导双链断裂。像ZFN和TALENs一样,CRISPR/Cas9也使用HDR,但是使用RNA来指定编辑使得该系统更便宜、更省时、更精确。与TALENs相比,CRISPR的应用更为广泛,每周都会有使用该技术发表的新论文。
Cre-loxp系统的优点:
说到这里,大家是不是都觉得Cre-loxp系统是一个非常有趣的工具?Cre-LoxP系统是在神经系统中应用最广泛的条件性基因敲除工具,Cre-loxp系统优点如下:
◉ 高效性:Cre重组酶与具有LoxP位点的DNA片段形成复合物之后,可以提供足够的能力引发之后的DNA重组过程,重组过程简约高效;
◉ 特异性强:LoxP序列的唯一性,保证基因重组的特异性;
◉ 应用范围广:Cre重组酶可以在生物体不同的组织、不同的生理条件下发挥作用;
◉ 可由二型启动子启动表达:Cre重组酶的编码基因可由任何一种二型启动子驱动,由此保证Cre重组酶在生物体不同的细胞、组织、器官或者在不同的发育阶段或不同的生理条件下表达,从而实现较高的组织和细胞特异性。
Cre/loxp系统的应用:
Cre/loxp系统是一种完善的研究工具,由于上述优点而应用广泛,尤其是在转基因小鼠领域。最常见的用途有:
◉ Cre依赖性基因表达:在目标基因上游放置两边都带有loxP位点的终止密码子(通常称为“ lox-stop-lox”或“ LSL”表达盒),在没有Cre重组酶的情况下,将阻止基因表达;在Cre存在的情况下,切除终止密码子,基因表达;
◉ Cre依赖性基因敲除:将loxP位点置于基因的两侧(称为“ floxing”,意为“flanked by loxP”),在Cre不存在时允许基因表达;当Cre存在时该基因表达将被破坏或删除;
◉ 选择标记的去除:在常规的小鼠编辑中,通常使用选择标记进行目标克隆筛选,但是在初始选择过之后,通常希望删除标记。此时通过对选择标记进行floxing处理,利用Cre可轻松执行此操作;
◉ 调节Cre表达:在发育的某些阶段通过将Cre置于特异性启动子下游,或通过将Cre置于诱导启动子(例如强力霉素诱导表达系统),这样Cre重组酶只能在指定的细胞中或指定的时间表达,同时结合上述一些loxP使用方法,可以进行不同要求的基因修饰。
四、CRISPR
CRISPR是细菌免疫系统的重要组成部分,可使细菌记住并破坏噬菌体。在基因编辑应用中,Cas9核酸内切酶通过gRNA序列进行靶向,从而诱导双链断裂。像ZFN和TALENs一样,CRISPR/Cas9也使用HDR,但是使用RNA来指定编辑使得该系统更便宜、更省时、更精确。与TALENs相比,CRISPR的应用更为广泛,每周都会有使用该技术发表的新论文。