蛋白质组学研究，这篇够经典！ 蛋白组学分析

蛋白组学分析 蛋白质组学研究，这篇够经典！

作者：盛师傅
今天教大家用蛋白质组学文章，从技术上轻松灌水博士毕业神刊oncotarget 发文章除了自身水平外，也看很多其他的的方面，懂的都懂。
在正文开始之前，推荐蛋白质组学的一本书和一篇综述，书是冷泉港蛋白质组学实验手册，适合完全不懂零基础的开始学，综述是chemical review 影响因子有40多，化学类第一高上的Protein Analysis by Shotgun/Bottom-up Proteomics，适合有一定基础的看。
好了，现在开始正题，什么是蛋白质组学，Proteomics includes not only the identification and quantification of proteins, but also the determination of their localization, modifications, interactions, activities, and, ultimately, their function。
我们主要讲的就是identification and quantification of proteins，这就引出了两类文章，第一种是尽可能多的鉴定细胞或组织中一切蛋白质，这一部分跟分析化学有关就不多讲，第二种是差异蛋白质组学，通过寻找各种因素引起的蛋白质表达差异，以解释细胞生理和病理机制。
从医学角度来看，蛋白质组学整个实验流程简单易懂。第一步，不同组织或细胞样品间的蛋白质的分离，第二步蛋白质鉴定、定量，找出有显著表达差异的蛋白。第三步，在此基础上选定蛋白进行验证，最后生信分析 如下图。
其中分离有两套不同的流程，第一个是top-down 直接分离蛋白质，主要技术是二维电泳 不推荐，很麻烦。第二个是buttom-up 分离蛋白质酶解后得到的多肽,主要技术是LC。