上海本轮监测到30个奥密克戎亚型毒株,究竟是怎么一回事?

正文摘要:
· 上海最新监测到的XBB.1.5毒株，已在美国强势崛起。其显著的增长优势，归功于新突变大大增强了它与ACE2的结合，还可能使其获得更多突变。澎湃科技记者获悉，这些样本来自上海地区新冠患者，随机采集于今年11月23日至12月22日，经基因测序确认30个已知奥密克戎亚型毒株，尚未发现新的新冠病毒变异株。上海近期新冠病毒基因测序结果。据上海瑞金医院官方通报，为了评估调整疫情防护措施之后奥密克戎毒株在境内的传播模式，上述研究团队分析了当前境内流行的奥密克戎亚型种类。
上海本轮监测到30个奥密克戎亚型毒株究竟是怎么一回事，跟随小编一起看看吧。
· 上海最新监测到的XBB.1.5毒株，已在美国强势崛起。其显著的增长优势，归功于新突变大大增强了它与ACE2（新冠病毒受体）的结合，还可能使其获得更多突变。
近日，全球共享所有流感数据倡议（GISAID）数据库新增369条中国本土新冠病毒测序结果，上传者为上海交通大学医学院附属瑞金医院（以下简称“上海瑞金医院”）陈赛娟与上海市公共卫生临床中心（以下简称“上海公卫中心”）范小红领衔的联合科研攻关团队。
澎湃科技记者获悉，这些样本来自上海地区新冠患者，随机采集于今年11月23日至12月22日，经基因测序确认30个已知奥密克戎亚型毒株，尚未发现新的新冠病毒变异株。除了“南方株”BA.5.2和“北方株”BF.7相会于上海，在欧美广泛流行的BQ.1家族和XBB家族占比超过1/3——这些病例绝大多数为境外输入病例，处于闭环单独管理中，因此并未造成BQ.1家族和XBB家族的本土大规模传播。

上海近期新冠病毒基因测序结果。来源：上海交通大学医学院
未出现新的新冠病毒变异株
据上海瑞金医院官方通报，为了评估调整疫情防护措施之后奥密克戎毒株在境内的传播模式，上述研究团队分析了当前境内流行的奥密克戎亚型种类。研究论文《初步分析我国2022年秋冬新冠疫情中奥密克戎亚型多样性与流行病学特征》（Primary assessment of the diversity of Omicron sublineages and the epidemiologic features of autumn/winter 2022 COVID-19 wave in Chinese mainland）发表在《Frontiers of Medicine》上。
研究人员对2022年秋冬期间上海公卫中心收治的患者中随机抽取的378例样本进行基因组测序，获得369个高质量新冠病毒全基因组序列。分子进化树分析发现，这些病毒基因组中共包含GISAID数据库里记录的30个奥密克戎亚型毒株，其中355个（95.95%）基因组序列集中在5个奥密克戎亚系，主要毒株包括已报道在北京和广州等地流行的BF.7和BA.5.2和近期欧美地区出现的BQ.1和XBB。结合感染者的旅行史和感染接触史，证明有北京或广州疫情接触史者分别主要携带BF.7和BA.5.2亚株；从海外入境上海的感染者主要携带BQ.1和XBB；而上海本地感染者中除了BA.5.2以外，还有多个奥密克戎亚株相对占比较高。这些结果中尚未发现新的新冠病毒变异株。